دانلود پایان نامه ارشد رشته زیست شناسی : بررسی تنوع ژنتیکی بنفشه آفریقایی Saintpauia ionantha

متن کامل پایان نامه مقطع کارشناسی ارشد رشته زیست شناسی گیاهی

با عنوان :  بررسی تنوع ژنتیکی بنفشه آفریقایی Saintpauia ionantha

در ادامه مطلب می توانید تکه هایی از ابتدای این پایان نامه را بخوانید

و در صورت نیاز به متن کامل آن می توانید از لینک پرداخت و دانلود آنی برای خرید این پایان نامه اقدام نمائید.

دانشگاه آزاد اسلامی واحد دامغان

پایان نامه

برای دریافت درجه کارشناسی ارشد در رشته زیست­ شناسی گیاهی

موضوع :

بررسی تنوع ژنتیکی بنفشه آفریقایی(Saintpauia ionantha) با استفاده از مارکر مولکولی RAPD

استاد راهنما :

جناب آقای دکتر مصطفی عبادی

استاد مشاور :

جناب آقای دکتر حسین عباس­پور

برای رعایت حریم خصوصی نام نگارنده درج نمی شودتکه هایی از متن به عنوان نمونه : (ممکن است هنگام انتقال از فایل اصلی به داخل سایت بعضی متون به هم بریزد یا بعضی نمادها و اشکال درج نشود ولی در فایل دانلودی همه چیز مرتب و کامل است)فهرست چکیده. 1فصل اول. 2کلیات تحقیق.. 21-1. اهداف اصلاحی در بنفشه آفریقایی.. 51-2. تنوع ژنتیکی و ضرورت شناخت آن. 61-3. روش­های برآورد تنوع ژنتیکی.. 71-3-1. برآورد تنوع ژنتیکی با استفاده از نشانگرهای دی ان ای.. 8فصل دوم. 9ادبیات و پیشینه تحقیق. 92-1. گیاه­شناسی بنفشه آفریقایی.. 92-1-1. میوه در Saintpaulia. 102-2. خاستگاه و پراکنش بنفشه آفریقایی.. 112-3. گونه­های مهم بنفشه آفریقایی.. 112-3-1. برخی گونه­های فهرست شده به دنبال طبقه بندی Burtt 122-4. کشت و تکثیر. ...132-4-1. شرایط کشت بنفشه آفریقایی.. 132-5. بیماری­های مربوط به بنفشه آفریقایی.. 172-5-1. بیماری­های ناشی از عوامل غیر زیستی.. 172-5-2. بیماری­های ناشی از عوامل زیستی.. 182-6. اهمیت بنفشه آفریقایی.. 202-7. اصلاح بنفشه آفریقایی.. 212-7-1. روش­های اصلاحی.. 212-8. اهمیت تنوع ژنتیکی.. 212-9. حفاظت منابع ژنتیکی.. 222-10. روش‌های ارزیابی تنوع ژنتیکی.. 232-10-1. نشانگرهای مورفولوژیکی.. 232-10-3. نشانگرهای مولکولی.. 242-10-4. نشانگرهای پروتئینی.. 242-10-5. نشانگرهای DNA.. 242-10-6. نشانگرهای غیرمبتنی بر پی سی آر. 262-10-7- نشانگرهای مبتنی بر پی سی آر. 272-10-8. DNA پلی مورف تکثیر یافته تصادفی.. 312-10-8-1. کاربرد به کارگیری تکنیک RAPD ..322-10-8-2. کاربردهای نشانگر RAPD .....322-10-8-3. مزایای نشانگرهای RAPD ..............322-10-8-4. معایب نشانگرهای RAPD ..........342-10-8-5. ویژگی­ها و کاربردهای نشانگرهای مرتبط با RAPD ..........352-11. واکنش زنجیره پلی­مراز. 372-11-1. اجزای واکنش زنجیره‌ای پلیمراز(PCR) 382-11-2. مراحل تکثیر. 402-11-3. کاربردهای پی سی آر. 412-12. الکتروفورز. 422-12-1. الکتروفورز ژل آگارز. 432-13. درخت فیلوژنتیک... 452-13-1. پیچیدگی ژنوم و بررسی فیلوژنتیک: 452-13-2. اندازه‌گیری فواصل و تشابهات ژنتیکی.. 492-13-3. روش‌های آماری برای تجزیه و تحلیل تنوع ژنتیکی.. 502-13-4. تجزیه خوشه‌ای.. 502-13-5. ضریب همبستگی کوفنتیکی.. 512-13-6. تجزیه به مؤلفه­های اصلی.. 512-14. مروری بر تحقیقات پیشین.. 52فصل سوم........57روش شناسی تحقیق.. 573-1. تهیه نمونه گیاهی.. 573-2. استخراج DNA.. 573-3. تعیین کیفیت نمونه­های DNA.. 593-4. تعیین کمیت نمونه‌های DNA.. 603-5. تنظیم غلظت نمونه‌های DNA 603-6. انتخاب آغازگرها 603-7. انجام واکنش‌های زنجیره‌ای پلیمراز. 603-8. الکتروفورز فراورده‌های PCR.. 623-9. تجزیه و تحلیل‌های آماری.. 62فصل چهارم. 64تجزیه و تحلیل داده­ها 644-1. تعیین کمیت و کیفیت DNA ژنومی.. 644-2. واکنش زنجیره‌ی پلیمراز. 654-3. تجزیه باندهای ایجاد شده 664-3-1. بررسی محتوای اطلاعاتی به دست آمده 674-4. تجزیه خوشه‌ای.. 72فصل پنجم. 74بحث و نتیجه­گیری.. 745-1. استخراج DNA.. 745-2. واکنش زنجیره پلی­مراز.......755-2-1. بهینه سازی مواد به کار رفته در پی سی آر...........755-2-2. بهینه سازی شرایط پی سی آر...............755-3. پیشنهادات.. 76منابع. 78پیوست... 82چکیده انگلیسی. 84بررسی تنوع ژنتیکی بنفشه آفریقایی(Saintpauli ionantha) با استفاده از مارکر مولکولی RAPD چکیدهتنوع ژنتیکی و ارزیابی ارقام مطرح بنفشه­ی آفریقایی(Saintpauli ionantha) در سطح مولکولی با استفاده از نشانگر RAPD انجام شد. به منظور استخراج DNAاز روش تغییر یافته Doyle and Doyle استفاده شد و در گام بعد 6 ژنوتیپ با 15 آغازگر مورد بررسی قرار گرفتند. از 15 آغازگر مورد بررسی روی DNA ژنومی 311 باند تولید شد که 290 باند پلی مورفیسم داشتند. آغازگر I، کمترین باند و آغازگر G بیشترین باند را تولید کرد. اندازه­ی قطعات DNA تولید شده بین 200 بیس باز تا 4000 بیس باز بود. میانگین قدرت تفکیک نیز 79/0 بود. باندهای تولید شده برای آنالیزهای استاتیک مورد استفاده قرار گرفتند. برای رسم درخت فیلوژنیک از نرم افزار UPGMA استفاده شد. تشابه ژنتیکی بین 57/0 تا 72/0 است. و ضریب جاکارد بین دندروگرام و ماتریس تشابه 78/0 به دست آمد که نشان دهنده برازش مناسب دندروگرام به ماتریس تشابه بوده است. نتایج به دست آمده نشان می­دهد که نشانگر مولکولی RAPD ابزاری سودمند برای بررسی پراکندگی ژنتیکی و ارتباطات خانوادگی بین واریته­های بنفشه­ی آفریقایی است.کلمات کلیدی: بنفشه­ی آفریقایی، مارکر مولکولی، تنوع ژنتیکی، آنالیزهای استاتیک، درخت فیلوژنیکلیات تحقیقجمعیت جهان در قرن 21 از مرز 6 میلیارد نفر کنونی گذشته و به بیش از 10 میلیارد نفر خواهد رسید. یکی از معایب این افزایش جمعیت استفاده بی­رویه از منابع طبیعی در جهت افزایش تولیدات کشاورزی می‌باشد. در بسیاری از این موارد، این افزایش تولید با تخریب منابع زیستی و فرسایش شدید ذخایر توارثی همراه بوده است. حفاظت و استفاده از منابع ژنتیکی گیاهی برای بقاء و بهبود تولیدات زراعی ضروری می‌باشد و به عنوان نیاز اساسی در توسعه پایدار، خلق واریته­های جدید، و کاهش فقر محسوب می‌شود.تنوع، مبنای همه گزینش­ها است و انتخاب ژنوتیپی نیز نیازمند تنوع است. با بالا رفتن تنوع ژنتیکی در یک جامعه، حدود انتخاب هم در طبیعت و هم به­طور مصنوعی وسیع می‌شود. با توجه به رابطه مثبت بین میزان تنوع ژنتیکی و مقدار وقوع تغییرات تکاملی در آن، رابطه مشابه­ی نیز بین کارایی بهبود ژنتیکی اصلاح یک جامعه و تنوع ژنتیکی برای صفت مورد علاقه موجود است. تمایل به حذف تنوع ژنتیکی در توده­های بومی اولیه، واریته­های سازگار به نیازهای غیر قابل پیش بینی آینده را به خطر می­اندازد.بنابراین حفظ و نگهداری ذخایر توارثی ضروری می‌باشد. به­طور کلی یکی از اولین قدم­ها در یک برنامه به نژادی موفق، تشخیص صحیح ژنوتیپ‌های مطلوب است، که برای صحیح عمل نمودن دراین راستا به نکات خاصی باید توجه نمود. اثرات متقابل ژنوتیپ و محیط، اتخاذ روش صحیح گزینش، و استفاده از نشانگرهای مولکولی مناسب برای تشخیص ژنوتیپ­ها تو صیه می‌گردد (صالحی، 1378).برای بررسی تنوع ژنتیکی، نشانگرهای مختلفی وجود دارد که شامل نشانگرهای فیزیولوژیکی، بیوشیمیایی، و مولکولی می­باشد.از معایب نشانگرهای فیزیولوژیکی این است که در بیشتر موارد تحت تأثیر محیط قرار دارند و گاهی برای مشاهده و ثبت آن­ها باید منتظر ظهور آن­ها ماند که در مورد گیاهان چند ساله بسیار مشکل می‌نماید. علاوه براین تعداد نشانگرهای مورفولوژیکی کم می‌باشد.نشانگرهای پروتئینی نیز معایب مخصوص خود را دارا می‌باشند؛ با توجه به این­که روش­های رنگ آمیزی پروتئین­ها در مورد آیزوزایم­ها چندان زیاد نیست، تعداد آیزوزایم­ها قابل ثبت و مشاهده که می­توان از آن­ها به عنوان نشانگر استفاده نمود، به صد نمی‌رسد که این محدودیت از عمده ترین معایب آن­ها است و موجب کاهش کارایی آن­ها می‌گردد. از نکات منفی دیگر این نشانگرها، محدودیت تنوع ژنتیکی قابل ثبت در آیزوزایم­ ها است. به عبارت دیگر آیزوزایم­ها نه تنها کم هستند، بلکه چند شکلی و تفاوت قابل ثبت نیز در آن­ها چندان زیاد نیست. لذا با توجه به معایب نشانگرهای مورفولوژیکی و پروتئینی بهتر است از نشانگرهای مولکولی استفاده کرد، زیرا در آن­ها دقت بالا بوده و کمتر تحت تأثیر شرایط محیطی و غیره قرار می­گیرند (قره­یاضی، 1377).روش­های مختلف انگشت نگاری دی ان ای[1] اغلب به دلایل ذیل با هم تفاوت دارند:1- پیچیدگی روش­های مورد استفاده2- مقادیر دی ان ای ژنومی3- نیاز به اطلاع از توالی ژنومی4- قدرت تحلیل و تعیین وابستگی ژنومی5- مقدار هزینه6- وسعت کاربرددر این بین نشانگر رپید[2] در بررسی تنوع ژنتیکی بین ارقام زراعی، طبقه بندی آن­ها و نیز تهیه نقشه‌های پیوستگی و آنالیز ژرم پلاسم کاربرد وسیعی پیدا کرده است (اهم و مکنزی، 1992)[3].نشانگرهای رپید به وسیله تکثیر تصادفی قطعات دی ان ای[4] ژنومی با آغازگرهای منفرد 10 نوکلئوتیدی همراه با توالی‌های اختیاری به­دست می‌آیند و مزایای فراوانی نسبت به سایر نشانگرها دارند از جمله می­توان به میزان هزینه و کار کمتر، نیاز کمتر به تکنولوژی پیشرفته، نامحدود بودن تعداد، امکان بررسی همزمان چندین لوکوس در ژنوم نمونه‌ها، تجزیه و تحلیل سریع و آسان تعداد زیادی از نمونه­ها، و عدم استفاده از مواد خطرناک رادیواکتیو اشاره کرد (کیانی و همکاران، 1381).از کاربردهای رپید می‌توان به موارد ذیل اشاره کرد(کیانی و همکاران، 1381):1) تعیین جنسیت2) تولید آغازگرهای اختصاصی واکنش زنجیره پلی­مراز برای ژنوم­های ناشناخته3) تجزیه و تحلیل کمی نمونه­های زیستی مختلف4) بررسی روند تکامل و رده­بندی موجودات5) تجزیه تحلیل ژرم­پلاسم‌ها6) تعیین قرابت و یا فاصله ژنتیکی گونه‌هابا وجود صنعتی شدن کشورها و استرس­های ایجاد شده، داشتن محیطی آرام و زیبا یکی از ضروریات بوده است که گل­ها می­توانند بخشی از این آرامش را به جامعه انسانی هدیه دهند.بنفشه­ی آفریقایی به­عنوان عروس گل­های آپارتمانی در اروپا مطرح است که نقش به­سزایی در فراهم آوردن محیطی آرام و زیبا بازی می­کند. بنفشه­ی آفریقایی با نام علمی Saintpaulia ionantha(نام ionantha نیز در زبان یونانی به معنای شبیه بنفشه است) و با نام عمومی African violet، متعلق به خانواده­ی ژسناریاسه می­باشد و باید گفت که در حال حاضر حدود بیست گونه از آن شناخته شده است.بنفشه آفریقایی در سال 1892 میلادی در آفریقای شرقی توسط بارون والتر فونت سنت پل کشف گردید. او به افتخار نام خانوادگی خود که برای اولین بار این گیاه را کشف نموده بود آن را سنت پولیا نام­ گذاری کرد. این گیاه در کشور آلمان به نام بنفشه اوزامبارا نیز معروف می­باشد .آب و هوای حاره­ای شرایط مناسبی برای رشد این گیاه می­باشد (ایستوود، 1998)[5]. این گیاه بومی نقاط گرمسیری آفریقایی جنوبی است و از لحاظ کرموزومی این گیاه دیپلوئید بوده و به­صورت 2n=30 است (میرانتو، 2005) .[6]بنفشه­ی آفریقایی گیاهی نهاندانه بوده و بذرهای آن در تخمدان گل محفوظ می­ماند. این گیاه دولپه­ی بوده، جام گل به­طور معمول دو لپه یعنی به دو دسته گلبرگ­های بالا و پایین تقسیم می­شود. هر یک از گل­ها دارای دو تا چهار بساک مسئول تولید گرده بوده که به انتهای گل متصل است و نزدیک تخمدان قرار دارد. ساقه که گل­ها را بر روی خود نگه می­دارد از دو قسمت اصلی و فرعی تشکیل می­گردد.رنگ بنفش گل این گیاه در یک دوره گلدهی ممکن است به­صورت تیره و یا روشن درآید و در دوره­ی دیگر به دلیل نوسانات اسیدی یا قلیایی بودن خاک، اثر آبیاری و یا کوددهی تبدیل به ارغوانی شود. سبزی برگ بنفشه آفریقایی، گاهی به­صورت دو رنگ نمایان می­شود که علت آن وجود رنگدانه­های کلروفیل، کاروتن و آنتوسیانین است که در هر سلول برگ وجود دارد. دلیل ابلق بودن برگ در این گیاه نبود کلروفیل در قسمتی از برگ می­باشد. گیاهان با برگ­های ابلق به­طور عموم گیاهان ضعیف­تری هستند و احتیاج به مراقبت و توجه بیشتری دارند. رعایت بعضی نکات پرورشی مانند هوای به نسبت خنک، نور کم و استفاده از کود بدون نیتروژن باعث بروز برگ­های ابلق می­گردد.به طور کلی این گیاه به دو شکل رشد می­کند:1- رشد گیاه با برگ­های متقارن و مشابه گل رز که شکل رایج رشد است.2- رشد گیاه که به صورت رونده که اغلب برای قرار دادن در گلدان­های آویز بسیار مناسب است (چارلز، 1998)[7].اولین جشنواره­ی بنفشه­ی آفریقایی در 1946 میلادی در آتلانتای گرجستان برگزار شد. شهرت این گیاه در حدی است که پلیس آتلانتا برای کنترل ترافیک از آن استفاده کرد. انجمن بنفشه­ی آفریقایی چندی بعد در آمریکا برپا شد و امروزه در بسیاری از کشورهای مدرن می­توان آن­را مشاهده کرد (کامپر، 2002)[8].1-1. اهداف اصلاحی در بنفشه آفریقاییاهداف اصلاحی هر محصولی بسته به نیاز هر منطقه متفاوت می‌باشد. به­طور خلاصه می‌توان اهداف اصلاحی هر محصول را به چهار گروه شامل عملکرد به تنهایی، کیفیت بذر، مقاومت به آفات و بیماری­ها و اصلاح خصوصیات زراعی تقسیم بندی نمود. برای انجام موفقیت آمیز اصلاح یک گیاه زراعی اولین کار یافتن تنوع ژنتیکی مطلوب می‌باشد (عزیزی وهمکارن، 1378).الف) اصلاح برای صفات زراعی و عملکرداصلاح در جهت افزایش عملکرد از مهمترین اهداف اصلاحی در گیاهان می‌باشد که در این گیاه ماندگاری بالا و گل­دهی به موقع دارای ارزش است. به نژادگر در این خصوصی از روش­های متفاوتی استفاده می‌نماید. لذا، یکی از روش­های اصلاحی در این زمینه تعیین والدین مطلوب برای بهره­گیری بیشتر از هتروزیس می‌باشد.ب) اصلاح برای مقاومت به بیماری­ها و آفاتبرخی از بیماری­ها و آفات در بنفشه­ آفریقایی مشکلاتی را ایجاد می­کند. ابتدا یافتن منابع مقاومت به بیماری و راه­های مؤثر به­گزینی ژنوتیپ­های مقاوم است. صفت مورد نظر سپس بایستی به یک رقم یا هیبرید منتقل شود.تعداد صفحه :95قیمت : چهارده هزار تومان

بلافاصله پس از پرداخت ، لینک دانلود به شما نشان داده می شود

و به ایمیل شما ارسال می شود.

پشتیبانی سایت :        09124404335        info@arshadha.ir

در صورتی که مشکلی با پرداخت آنلاین دارید می توانید مبلغ مورد نظر برای هر فایل را کارت به کارت کرده و فایل درخواستی و اطلاعات واریز را به ایمیل ما ارسال کنید تا فایل را از طریق ایمیل دریافت کنید.

--  -- --

مطالب مشابه را هم ببینید

فایل مورد نظر خودتان را پیدا نکردید ؟ نگران نباشید . این صفحه را نبندید ! سایت ما حاوی حجم عظیمی از پایان نامه های دانشگاهی است. مطالب مشابه را هم ببینید. برای یافتن فایل مورد نظر کافیست از قسمت جستجو استفاده کنید. یا از منوی بالای سایت رشته مورد نظر خود را انتخاب کنید و همه فایل های رشته خودتان را ببینید