پایان نامه ارشد:مطالعه تئوری بر روی توتومری­های زانتین و بر هم­کنش این مولکول با آب و یون­های مختلف فلزی در حالت گازی و حلال

متن کامل پایان نامه مقطع کارشناسی ارشد رشته :شیمی

گرایش : آلی

عنوان : مطالعه تئوری بر روی توتومری­های زانتین و بر هم­کنش این مولکول با آب و یون­های مختلف فلزی در حالت گازی و حلال

دانشگاه یاسوج

دانشکده علوم

گروه شیمی

 

پایان نامهی کارشناسی ارشد رشتهی شیمی گرایش آلی

 

مطالعه تئوری بر روی توتومری­های زانتین و بر هم­کنش این مولکول با آب و یون­های مختلف فلزی در حالت گازی و حلال

استاد راهنما:

دکتر علیرضا سلیمی بنی

استاد مشاور:

دکتر شاپور رمضانی

بهمن ماه 1393

برای رعایت حریم خصوصی نام نگارنده پایان نامه درج نمی شود(در فایل دانلودی نام نویسنده موجود است)تکه هایی از متن پایان نامه به عنوان نمونه :(ممکن است هنگام انتقال از فایل اصلی به داخل سایت بعضی متون به هم بریزد یا بعضی نمادها و اشکال درج نشود ولی در فایل دانلودی همه چیز مرتب و کامل است)

فهرست مطالب

عنوان                                                                                                                                                       صفحهفصل اول: مقدمه و تاریخچه1-1- ترکیبات آلی حلقوی..................................................................................................................................................................................................... 11-1-1- ترکیبات هتروسیکل............................................................................................................................................................................................. 11-2- پیوند هیدروژنی................................................................................................................................................................................................................ 41-2-1- جاذبه بین مولکولی و پیوند هیدروژنی....................................................................................................................................................... 41-2-2- نقطه جوش و پیوند هیدروژنی........................................................................................................................................................................ 41-2-3- سایر خواص غیر عادی مربوط به پیوند هیدروژن............................................................................................................................. 41-2-4- شرایط تشکیل پیوند هیدروژنی قوی.......................................................................................................................................................... 51-2-5- نحوه تشکیل پیوند هیدروژنی.......................................................................................................................................................................... 51-2-6- شرایط تشکیل پیوند هیدروژنی...................................................................................................................................................................... 51-3- توتومری و تعریف آن..................................................................................................................................................................................................... 51-4- شیمی محاسباتی............................................................................................................................................................................................................ 61-4-1- روشهای نیمه تجربی............................................................................................................................................................................................. 81-4-2- روشهای آغازین........................................................................................................................................................................................................ 81-4-3- روش میدان خودسازگار هارتری- فاک................................................................................................................................................... 91-4-4- روش اختلال مولر-پلاست............................................................................................................................................................................ 101-4-5- روشهای نظری تابعیت چگالی15............................................................................................................................................................... 101-5- مجموعههای پایه......................................................................................................................................................................................................... 121-5-1- مجموعههای پایه زتای دوگانه و پایه زتای سه گانه.................................................................................................................... 131-5-2- مجموعه پایه قطبیده........................................................................................................................................................................................ 131-6- هدف.................................................................................................................................................................................................................................... 14فصل دوم: بخش نظری2-1- روش های محاسباتی................................................................................................................................................................................................ 162-3- فلسفه تئوری Gaussian 09............................................................................................................................................................................ 172-4- محاسبات در فاز حلال............................................................................................................................................................................................ 18فصل سوم: بحث و نتیجه گیری3-1- مقدمه................................................................................................................................................................................................................................. 183-2- بحث و نتیجه گیری................................................................................................................................................................................................... 183-2-1- بررسی حالت گازی............................................................................................................................................................................................ 203-3- بررسی پایداری توتومرها در حالت گازی...................................................................................................................................................... 203-4- بررسی ساختار توتومرها در حالت گازی...................................................................................................................................................... 233-5- بررسی پایداری توتومرها در حلال.................................................................................................................................................................... 263-6- اثر ویژه حلال................................................................................................................................................................................................................. 283-6-1- بررسی پایداری و ساختار.............................................................................................................................................................................. 283-7- بررسی محاسبات NBO و  Mulikenدر نه توتومر زانتین با استفاده از روش DFT و MP2 در فاز گازی 403-8- حالت گذار....................................................................................................................................................................................................................... 463-9- بررسی اوربیتال های HOMO و LUMO............................................................................................................................................. 483-10- نمایش اوربیتال های HOMO و LUMO......................................................................................................................................... 503-11- بررسی طول پیوند برای پایدارترین توتومر با یون های مختلف.................................................................................................... 523-12- نتیجه گیری............................................................................................................................................................................................................... 55مراجع:............................................................................................................................................................................................................................................... 20فهرست جدول­هاعنوان و شماره                                                                                                                                       صفحهجدول 3-1: انرژی کل محاسبه شده، پایداری نسبی و دادههای ترمودینامیکی ایزومرهای مختلف زانتین با روشهای DFT و MP2 و سطح پایه 6-311++G(d,p). 21جدول 3-2: طول پیوند ایزومرهای A-I زانتین محاسبه شده با روش DFT با مجموعه پایه 6-311++G(d,p) در حالت گازی   23جدول3-3: طول پیوند ایزومرهای A-I زانتین محاسبه شده با روش MP2 با مجموعه پایه 6-311G(d,p) در حالت گازی   24جدول 3-4: زاوایای پیوند ایزومرهای A-I زانتین محاسبه شده با روش DFT با مجموعه پایه 6-311++G(d,p) در حالت گازی   25جدول 3-5: زوایای پیوند ایزومرهای A-I زانتین محاسبه شده با روشهای MP2 با مجموعه پایه 6-311G(d,p) در حالت گازی   26جدول 3-6: پایداری نسبی و ممانهای دو قطبی ایزومرهای زانتین در حالت گازی و حلال محاسبه شده با روش DFT و MP2 با مجموعههای پایه 6-311++G(d,p) و 6-311G(d,p). 27جدول 3-7: انرژی نسبی، استحکام باند و فاصله پیوند هیدروژنی برای توتومرهای زانتین با روش DFT و مجموعه پایه 6-311++G(d,p) 35جدول 3-8: محاسبه انرژی فعال سازی و انرژی آزاد نسبی بر حسب کیلو کالری بر مول برای توتومرهای زانتین با استفاده از یک مولکول آب با روش DFT و مجموعه پایه B3LYP/6-311++G(d,p). 36جدول 3-9: محاسبه تغییرات NBO در اتم برای توتومرهای زانتین با روشهای DFT و MP2 در دو فاز گازی و حلال  40جدول 3-10: محاسبه تغییرات Muliken در اتم برای توتومرهای زانتین با در روشهای DFT و MP2 در دو فاز گازی و حلال  43جدول3-11: انرژی فعالسازی و انرژی آزاد نسبی بر حسب کیلو کالری بر مول برای توتومرهای زانتین محاسبه شده با B3LYP/6-311++G(d,p) 46جدول3-12: پارامترهای انرژی توتومرهای زانتین به روش DFT در فاز گازی بر حسب (ev). 49جدول 3-13: بررسی طول پیوند پایدارترین توتومر زانتین با یونهای مختلف با روش DFT و سطح پایه 6-311++G(d,p). 52فهرست شکل هاعنوان و شماره                                                                          صفحهشکل 1-1: ساختار برخی از پورینها 3شکل 2-1: توتومرهای زانتین... 17شکل 3-1 . ساختار و شماره گذاری توتومرهای زانتین... 20شکل3-2: ساختار بهینه شده ترکیبات مورد مطالعه با روش B3LYP/6-311++G(d,p). 22شکل 3-4: اوربیتالهای HOMO و LUMO.... 49شکل 3-5: ساختار پایدارترین توتومر زانتین با فلزها 54

چکیده:

زانتین (7،3- دی هیدرو- پورین-6،2- دی­اون)، یک باز پورین است که در بیشتر بافت‌ها و مایع‌ها و دیگر اندام‌های زنده بدن انسان یافت می‌شود. خواص ویژه و منحصر به فرد زانتین و مشتقات آن از جمله خواص زیستی و دارویی آن از اهمیت بسیاری برخوردار می­باشد. در بازهای پورین بیشتر در بافت­های بدن انسان یافت می­شوند و آن­ها در نوشیدنی­هایی مثل چای، قهوه و کوکا نیز وجود دارند. محاسبات تئوری بر روی توتومرهای زانتین با استفاده از GAUSSIAN 09 و Gauss-View برنامه تجسم مولکولی بر روی کامپیوترشخصی انجام شد. مطالعات بر روی ساختار توتومرها در فاز گازی و چندین حلال مورد بررسی قرار گرفت. همچنین برهم­کنش ویژه توتومر با یک مولکول آب با روش تابع عاملیت دانسیته (DFT/B3LYP) با سطح پایه 6-311++G(d,p) مورد بررسی قرار گرفت. به علاوه، تغییر ممان دو قطبی در فاز گازی و اثر حلال خاص با افزایش یک مولکول آب نزدیک مرکز الکترون دوستی توتومر‌ها، حالت گذار انتقال پروتون به وسیله یک مولکول آب بررسی شد و تغییرات NBO در اتم نیز مورد بررسی قرار گرفت. به کمک محاسبات DFT و MP2 در فاز گازی پایدارترین فرم این توتومرها بدست آمد.واژه­های کلیدی:زانتین، توتومری، اثر حلال، تابع عاملیت دانسیته

فصل اول

مقدمه و تاریخچه

ترکیبات آلی حلقوی

ترکیبات آلی حلقوی به دو دسته هموسیکلی [1]و هتروسیکلی[2] تقسیم می­شوند. حلقه­های هموسیکلی فقط دارای یک نوع اتم هستند، اما حلقه های هتروسیکلی علاوه بر کربن، یک یا چند اتم غیر کربن دارند. نیتروژن، اکسیژن و گوگرد رایج­ترین هترو­اتم ها هستند [1].اپوکسید­ها (اترهای حلقوی سه عضوی)، لاکتونها (استرهای حلقوی)، و پیریدین (یک باز حلقوی)، لاکتامها (آمیدهای حلقوی) و حلال­هایی از قبیل تتراهیدروفوران (یک اتر حلقوی) همگی ترکیبات هتروسیکل هستند.واسطه­های هتروسیکلی در سنتز به عنوان گروه­های محافظ، استفاده روز افزونی دارند، چنین گروه­هایی به آسانی تولید شده و در پایان کار به آسانی خارج می­گردند. اترهای تاجی نیز ترکیبات هتروسیکلی هستند. چون یکی از خواص معمولی اترها قابلیت حلال پوشی کاتیون­ها می­باشد، بنابراین این ترکیبات دارای اهمیت ویژه­ای هستند، زیرا مولکول­های آن­ها حلقوی و حلقه­هایی با اندازه­های خاص می­باشند که می­توانند کاتیون­ها را در داخل حفره خود قرار دهند. ترکیبات هتروسیکلی از جمله ترکیبات آلی هستند که خواص زیستی دارند. به عنوان مثال پنی سیلین (آنتی بیوتیک)، سایمتیدین (عامل ضد زخم معده) و ساخارین (ماده شیرین کننده مواد غذایی)، همگی در شمار ترکیبات هتروسیکلی هستند [1].تعداد صفحه : 68قیمت : 14000تومان

بلافاصله پس از پرداخت ، لینک دانلود پایان نامه به شما نشان داده می شود

و در ضمن فایل خریداری شده به ایمیل شما ارسال می شود.

پشتیبانی سایت :        09309714541 (فقط پیامک)        info@arshadha.ir

در صورتی که مشکلی با پرداخت آنلاین دارید می توانید مبلغ مورد نظر برای هر فایل را کارت به کارت کرده و فایل درخواستی و اطلاعات واریز را به ایمیل ما ارسال کنید تا فایل را از طریق ایمیل دریافت کنید.

--  -- --

مطالب مشابه را هم ببینید

فایل مورد نظر خودتان را پیدا نکردید ؟ نگران نباشید . این صفحه را نبندید ! سایت ما حاوی حجم عظیمی از پایان نامه های دانشگاهی است. مطالب مشابه را هم ببینید. برای یافتن فایل مورد نظر کافیست از قسمت جستجو استفاده کنید. یا از منوی بالای سایت رشته مورد نظر خود را انتخاب کنید و همه فایل های رشته خودتان را ببینید